Kongelejren har tilhørt Apostolsk Kirke, som købte stedet i 1945, og som har været samlingssted for børn og unge i alle årene.
De første bygninger stammer fra samme tid, men er siden ad flere omgange blevet nedrevet og genopbygget. Den nuværende spise- og opholdsbygning er opført i årene 1974-78.
I vinteren 2000-2001 blev Kongelejren totalrenoveret.
Kongelejren er blevet opført på frivillig basis af mennesker med tilknytning til lejren, hvilket har kostet mange arbejdstimer.
I juli 2024 er Kongelejren solgt til Højby Byg ApS.
